Batman ailesi günümüze döndüğünde Japonya'nın ortadan kaybolduğunu ve dev bir adanın, Gotham Şehri'nin üzerinde olduğunu keşfeder. Adanın tepesinde, onur ve insanlıktan yoksun bir şekilde hüküm süren ve Adalet Birliği'ne şüpheli bir şekilde benzeyen süper güçlü bir grup olan Yakuza oturmaktadır. Şimdi Gotham'ı kurtarmak Batman ve müttefiklerine düşüyor.